摘要:采用生物學(xué)信息方法在miRBase中搜索動物miR-125a/125b基因家族序列,利用Ensembl數(shù)據(jù)庫信息確定miR-125a/125b在基因組中的位置,采用MEGA 5.0構(gòu)建miR-125a/125b家族的系統(tǒng)進化樹,并利用qRT-PCR檢測miR-125a和miR-125b在沙子嶺豬睪丸組織不同發(fā)育時期(D1、D30、D60、D90、D120、D150、D180)的表達變化。結(jié)果在miRBase數(shù)據(jù)庫檢索29個物種共58條miR-125家族序列,分布廣泛,且有高度的保守性,除一個位于內(nèi)含子區(qū),兩個位于外顯子區(qū),其余miR-125a/125b位于基因間隔區(qū),在進化過程中,同種物種的進化方向具有高度的一致性,進化速度也有所不同。qRT-PCR檢測結(jié)果顯示,miR-125a/125b在沙子嶺豬睪丸組織中不同發(fā)育時期的具有相同的趨勢,即出生后其表達水平緩慢升高,保育期開始降低,性成熟期又開始呈現(xiàn)升高趨勢,隨著體成熟表達量開始降低。本研究結(jié)果為進一步探明miR-125a/125b基因家族在豬睪丸組織中的功能及作用機制奠定基礎(chǔ)。
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