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吉氏巴貝斯蟲多個GPI錨定蛋白基因的篩選與生物信息學分析

摘要:吉氏巴貝斯蟲是一類紅細胞內專性寄生的血液原蟲,犬一旦感染終生帶蟲,治療后時有復發(fā),因此需要簡便快捷的臨床診斷方法及時確診治療。GPI錨定蛋白是蟲體表面重要的抗原分子,是很好的潛在診斷標識,在蟲體粘附、識別以及入侵紅細胞等過程中具有非常重要的作用。為了篩選吉氏巴貝斯蟲GPI錨定蛋白基因,通過搜索NCBI、Uniprot以及PiroplasmaDB數據庫中吉氏巴貝斯蟲表面抗原,與武漢株吉氏巴貝斯蟲數據庫作比對,篩選出可能的吉氏巴貝斯蟲武漢株的GPI錨定蛋白基因,并通過bigPI、PredGPI、GPI-SOM網站預測其GPI錨定位點。運用生物信息學分析軟件預測其氨基酸信號肽、跨膜區(qū)、疏水區(qū)以及結構域和抗原表位等,分析其生物信息特性。通過分析確定了5個吉氏巴貝斯蟲武漢株的GPI候選抗原,分別命名為BgP50-WH、BgP47-WH、BgP45-WH、BgP32-WH、BgP12-WH,其GPI錨定位點均位于C端,長度約為21~22個氨基酸,均有信號肽并含有4個抗原表位。分析結果表明,這5個GPI抗原均有望成為吉氏巴貝斯病的診斷標識,其中BgP47-WH和BgP50-WH與抗體親和力最強,最具有成為診斷標識的潛力。

關鍵詞:
  • 吉氏巴貝斯蟲  
  • gpi錨定蛋白  
  • 生物信息學  
  • 免疫原性  
作者:
戰(zhàn)雪燕; 聶政; 趙陽楠; 羅曉瑩; 李慕曉; 安曉夢; 敖陽思琦; 崔杰; 王森; 賀蘭; 趙俊龍
單位:
華中農業(yè)大學動物醫(yī)學院; 武漢430070
刊名:
中國動物傳染病學報

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中國動物傳染病學報緊跟學術前沿,緊貼讀者,國內刊號為:31-2031/S。堅持指導性與實用性相結合的原則,創(chuàng)辦于1993年,在全國同類期刊中發(fā)行數量名列前茅。